单细胞测序分析及单细胞转录组上机实训培训班通知
行业领域
生物信息学、单细胞测序技术、分子生物学
会议类型
培训班、技术研讨、实操培训
会议主题
单细胞测序技术应用与数据分析、单细胞转录组上机实训
会议名称
单细胞测序分析及单细胞转录组上机实训培训班
基本信息
- 培训时间: 2019年11月15日至2019年11月18日
- 培训地点: 湖北武汉
- 主办单位: 中科成创(北京)生物技术有限公司
培训内容
单细胞测序技术与应用
- 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
- 单细胞测序技术在科研领域的应用。
- 近年单细胞方向高分文章思路解析。
- 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。
Linux及R语言入门与实操
- 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
- R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。
- R语言语法介绍及常用命令。
- 数据处理功能及统计应用。
- R语言画图实操。
单细胞转录组数据分析思路及流程
- 单细胞实验处理、建库及测序。
- 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。
- 单细胞转录组转录因子及功能通路解析。
- 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微生物等领域的研究内容及思路。
单细胞转录组数据分析实操
- 常规单细胞组学数据比对。
- 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。
- 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。
- 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。
- 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。
- 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。
多组学整合分析和结果解读
- 转录组,基因组,表观分析介绍。
- RNA和 ATAC-seq等多组学整合分析。
- 常规10X单细胞ATAC数据测序原理简介、分析流程介绍。
- 单细胞免疫组库测序技术及应用。
- 组学分析常用数据库介绍及使用。
单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操
- 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。
- 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。
- 通过SCENIC软件进行转录因子预测分析。
- tSNE,小提琴图,热图,网络图,GO、KEGG富集图,GSEA等图形绘制。
报名办法及费用
- 费用: 每人¥4300元(含报名费、培训费、资料费、上机费)
- 团队报名: 4+1优惠。(5位其中1位免除费用)
- 赠送: 所报名参加学员赠送一个8G U盘(内含上课所有使用软件与课件资料)
- 食宿: 可统一安排,费用自理。
联系方式
- 联系人: 张琦 177 4456 9660
- 报名邮箱: zkcc_BIS@vip.163.com
中科成创(北京)生物技术有限公司
二零一九年九月十八日